- Năm 1999: Xí nghiệp Sửa chữa và vận tải xăng dầu Đường sông được chuyển thành Công ty Cổ phần Vận tải Xăng dầu Đường thủy Petrolimex với vốn điều lệ ban đầu là 13.5 tỷ đồng.
- Năm 2003: Tăng vốn điều lệ lên 14.5 tỷ đồng.
- Năm 2004: Tăng vốn điều lệ lên 19.37 tỷ đồng.
- Năm 2006: Tăng vốn điều lệ lên 35 tỷ đồng.
- Ngày 28/12/2006: Chính thức giao dịch tại Sở Giao dịch Chứng khoán Thành phố Hồ Chí Minh (HOSE).
- Tháng 05/2008: Tăng vốn điều lệ lên 70 tỷ đồng.
- Năm 2009: Tăng vốn điều lệ lên 84 tỷ đồng.
- Tháng 09/2013: Tăng vốn điều lệ lên 96.59 tỷ đồng.
- Tháng 08/2014: Tăng vốn điều lệ lên 108.17 tỷ đồng.
- Tháng 11/2017: Tăng vốn điều lệ lên 153.6 tỷ đồng.
- Ngày 20/10/2021: Tăng vốn điều lệ lên 230.4 tỷ đồng.
- Tháng 10/2024: Tăng vốn điều lệ lên 248.8 tỷ đồng.