- Được hình thành và phát triển từ Khu đường sắt Bình Trị Thiên (QĐ thành lập Khu ĐS Bình Trị Thiên số: 2000/TC-ĐS ngày 28/11/1976)
- Ngày 31/12/1983 đổi tên thành Xí nghiệp quản lý đường sắt Bình Trị Thiên (QĐ số 908 ĐS/TC ngày 31/12/1983), là một đơn vị vận doanh trực thuộc Xí nghiệp Liên hợp VTĐS khu vực II, năm 1995 thực hiện QĐ số 46/QĐ/TTg chuyển đổi từ đơn vị Vận doanh sang đơn vị Sự nghiệp kinh tế)
- Ngày 20/03/2003 Bộ trưởng Bộ GTVT đổi tên thành Công ty Quản lý đường sắt Bình Trị Thiên (QĐ số 734/2003/QĐ-GTVT ngày 20/03/2003)
- Ngày 29/06/2010 TCT Đường sắt Việt Nam chuyển Công ty Quản lý đường sắt Bình Trị Thiên thành Công ty TNHH MTV Quản lý đường sắt Bình Trị Thiên (QĐ số 711/QĐ-ĐS ngày 29/06/2010)
- Ngày 10/12/2015, bán đấu giá cổ phần lần đầu tại CTCP Chứng khoán Ngân hàng Công thương Việt Nam (VietinBankSc), 26/12/2015 ĐHCĐ lần thứ nhất thành lập CTCP đường sắt Bình Trị Thiên
- Ngày 08/01/2016, chính thức đi vào hoạt động theo Giấy đăng ký doanh nghiệp CTCP với mã số doanh nghiệp: 3300269568 do Sở Kế hoạch đầu tư tỉnh Thừa Thiên Huế cấp thay đổi lần 2 với VĐL là 18,500,000,000 đồng
- Ngày 26/08/2016, giao dịch đầu tiên trên sàn UPCoM với giá tham chiếu 10,000 đ/CP.
- Ngày 25/06/2021 ngảy hủy đăng ký giao dịch trên UPCoM .
